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如何使用numpy向量化解決這個問題

2022-05-25 01:10:59 後端開發

我有一個非常大的輸入 numpy 陣列和一個字典。字典規定了 numpy 陣列中的值應該更新為什么。我可以使用 for 回圈來做到這一點,但它非常耗時,我可以使用 numpy 矢量化來解決這個問題嗎?

輸入:

arr_to_check = numpy.array([['A', 20],['B', 100],['C', 80],['D', 90], ['E', 100]]) # actual length is ~10^8
max_possible = {'A': 25, 'B': 40, 'C': 90, 'D': 50, 'F': 100, 'G': 90} # actual length is ~10^3

預期結果:

[['A', '20'], # do not change, because 20 < 25 --- max possible for 'A' is 25.
['B', '0'], # change to 0, because 100 > 50 --- max possible for 'B' is 40.
['C', '80'], # do not change, because 80 < 90
['D', '0'], # change to 0, because 90 > 50 --- max possible for 'D' is 50.
['E', '100' ]] 

這是回圈解決方案:

for i in range(arr_to_check.shape[0]):
    row = arr_to_check[i]
    if row[0] in max_possible and int(row[1]) > max_possible[row[0]]:
        row[1] = 0

uj5u.com熱心網友回復:

這是一種執行您所要求的方法(已更新以簡化代碼)。

先說幾點:

  • numpy 陣列必須是同質型別,因此您在問題中顯示的數字將由 numpy 轉換為字串以匹配標簽的資料型別(如果熊貓是一個選項,它可能允許您讓數字列共存具有不同的字串列)。
  • 盡管我已經將結果一路匹配以匹配原始同類資料型別(字串),但您可以提前停止并使用中間 1D 數值結果,如果這就是您所需要的。
  • 我已經用作數字型別,如果需要int,您可以將其更改為。float
import numpy
arr_to_check = numpy.array([['A', 20],['B', 100],['C', 80],['D', 90], ['E', 100]])
max_possible = {'A': 25, 'B': 40, 'C': 90, 'D': 50, 'F': 100, 'G': 90}
print('arr_to_check:'); print(arr_to_check)

aT = arr_to_check.T
labels = aT[0,:]
values = aT[1,:].astype(int)
print('labels:'); print(labels)
print('values:'); print(values)

for label, value in max_possible.items():
    curMask = (labels == label)
    values[curMask] *= (values[curMask] <= value)
print('values:'); print(values)

aT[1,:] = values
arr_to_check = aT.T
print('arr_to_check:'); print(arr_to_check)

輸入:

arr_to_check:
[['A' '20']
 ['B' '100']
 ['C' '80']
 ['D' '90']
 ['E' '100']]

輸出:

labels:
['A' 'B' 'C' 'D' 'E']
values:
[ 20 100  80  90 100]
values:
[ 20   0  80   0 100]
arr_to_check:
[['A' '20']
 ['B' '0']
 ['C' '80']
 ['D' '0']
 ['E' '100']]

解釋:

  • 轉置輸入,以便我們可以直接對數字向量 ( values) 使用向量化操作。
  • 如果標簽 (in ) 與 in 中的鍵匹配的行的值 in已被破壞,則遍歷 in 中的每個鍵/值對max_possible并使用向量化公式乘以0 valuesmax_possiblelabelsmax_possible
  • 使用 . 更新原始 numpy 陣列values

uj5u.com熱心網友回復:

正如其他人指出的那樣,numpy 陣列是同質的,您的輸出元素都將具有 str。如果沒問題,您可以使用apply_along_axis

t = lambda x: [x[0],0] if  x[0] in max_possible and int(x[1]) > max_possible[x[0]] else x
numpy.apply_along_axis(t, 1, arr_to_check)

uj5u.com熱心網友回復:

正如其他人所說,你應該只在你的 numpy 陣列中使用數字。所以你可以有這樣的資料:

arr_to_check = np.array([[0, 20],[1, 100],[2, 80],[3, 90], [4, 100]])
max_possible = np.array([25, 40, 90, 50, np.inf, 100, 90])

這里我假設 'A': 0, 'B': 1, ... 請注意,這樣,不僅字串已被數字替換,而且 dict 也已被 max_possible[i] 為 max 的 Numpy 陣列替換對于第i個字串,方便后續操作。

現在,您可以通過以下方式獲得所需的內容:

m = max_possible.take(arr_to_check.T[0]) 
m1 = np.array([arr_to_check.T[0], np.minimum(arr_to_check.T[1], m)]) 
m1.T
  • 第一行放入 m 每個鍵的最大值。

  • 第二行將 m1 您的鍵作為第一行,您的值的最小值和每個鍵的最大值

  • 第三行轉置為您的結果:

    陣列([[0., 20.], [1., 40.], [2., 80.], [3., 50.], [4., 100.]])

uj5u.com熱心網友回復:

運行您的代碼:

In [362]: %%timeit arr = arr_to_check.copy()
     ...: for i in range(arr.shape[0]):
     ...:     row = arr[i]
     ...:     if row[0] in max_possible and int(row[1]) > max_possible[row[0]]:
     ...:         row[1] = 0
     ...:         
14.1 μs ± 203 ns per loop (mean ± std. dev. of 7 runs, 100,000 loops each)

像這樣在陣列上迭代比使用串列要慢,所以讓我們嘗試一個純串列解決方案:

In [372]: alist_to_check = [['A', 20],['B', 100],['C', 80],['D', 90], ['E', 100]]
     ...: max_possible = {'A': 25, 'B': 40, 'C': 90, 'D': 50, 'F': 100, 'G': 90}

使用帶有 if/else 運算式的串列推導:

In [373]: [[k,0] if k in max_possible and v>max_possible[k] else [k,v] for k,v in alist_to_check]
Out[373]: [['A', 20], ['B', 0], ['C', 80], ['D', 0], ['E', 100]]

In [374]: timeit [[k,0] if k in max_possible and v>max_possible[k] else [k,v] for k,v in alist_to_check]
1.45 μs ± 3.2 ns per loop (mean ± std. dev. of 7 runs, 1,000,000 loops each)

其中一個答案建議apply_along_axis- 將鍵重新定義為整數。我的時機來了

In [366]: timeit np.apply_along_axis(t, 1, arr_to_check)
108 μs ± 2 μs per loop (mean ± std. dev. of 7 runs, 10,000 loops each)

舉一個小例子,純串列方法是最快的。對于非常大的情況,我們可能會將其視為一個可擴展的 numpy 問題,但我沒有看過這些選項。

結構化陣列

我們可以將串列轉換為結構化陣列。這保留了字串和 int dtypes:

In [398]: arr = np.array([tuple(kv) for kv in alist_to_check],'U10,int')

In [399]: arr
Out[399]: 
array([('A',  20), ('B', 100), ('C',  80), ('D',  90), ('E', 100)],
      dtype=[('f0', '<U10'), ('f1', '<i4')])

In [400]: arr['f0']
Out[400]: array(['A', 'B', 'C', 'D', 'E'], dtype='<U10')

In [401]: arr['f1']
Out[401]: array([ 20, 100,  80,  90, 100])

如果max_possible相對于串列較小,則迭代其專案并設定結構化陣列的相應元素可能是最有效的。例如:

def foo(alist):
    arr = np.array([tuple(kv) for kv in alist],'U10,int')
    for k,v in max_possible.items():
        idx = np.nonzero((arr['f0']==k) & (arr['f1']>v))[0]
        arr['f1'][idx] = 0
    return arr

In [395]: foo(alist_to_check)
Out[395]: 
array([('A',  20), ('B',   0), ('C',  80), ('D',   0), ('E', 100)],
      dtype=[('f0', '<U10'), ('f1', '<i4')])

對于這個示例,時間不是那么好:

In [397]: timeit foo(alist_to_check)
102 μs ± 360 ns per loop (mean ± std. dev. of 7 runs, 10,000 loops each)

對于一個大串列:

In [403]: biglist = alist_to_check*10000

In [409]: timeit foo(biglist)
44.1 ms ± 209 μs per loop (mean ± std. dev. of 7 runs, 10 loops each)

In [410]: timeit [[k,0] if k in max_possible and v>max_possible[k] else [k,v] for k,v in biglist]
14.8 ms ± 682 μs per loop (mean ± std. dev. of 7 runs, 100 loops each)

時間還沒有那么好。然而,其中很大一部分是創建結構化陣列:

In [411]: timeit arr = np.array([tuple(kv) for kv in biglist],'U10,int')
38.4 ms ± 49.5 μs per loop (mean ± std. dev. of 7 runs, 10 loops each)

如果我們已經有了結構化陣列,我希望時代會好很多。

奇怪的是,從中創建一個純字串 dtype 陣列biglist需要更長的時間:

In [412]: timeit np.array(biglist)
74.2 ms ± 1.17 ms per loop (mean ± std. dev. of 7 runs, 10 loops each)

盡管如此,這確實清楚地表明,作業dict和字串匹配,串列仍然與解決方案競爭numpynumpy最適合純數字作業。

轉載請註明出處,本文鏈接:https://www.uj5u.com/houduan/481085.html

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